В рамках настоящего исследования методом динамического светорассеяния была изучена способность белка Тамма-Хорсвалла из мочи здорового мужчины в возрасте 35 лет образовывать мегамолекулярные комплексы при повышении ионной силы и диссоциация этих комплексов при снижении ионной силы. Кроме того, данным методом были исследованы образцы мочи (без выделения БТХ) у здоровых людей и больных с верифицированным диагнозом мочекаменной болезни. Предложен простой подход к ранней диагностике уролитиаз, основанный на регистрации образования мегамолекулярных комплексов в моче при увеличении ионной силы раствора.

При анализе первичной структуры фибриллогенных пептидов впервые обнаружено наличие зеркально-симметричных мотивов. Впервые предложен и синтезирован способный к фибриллогенезу пептид, гомологичный фрагменту альфа-лактальбуминов. С помощью компьютерного моделирования и изучения свойств фибрилл такого пептида охарактеризован механизм его фибриллогенеза. Показано влияние такого пептида на фибриллогенез альфа-лактальбумина. Установлена роль участка последовательности 35-51 а.о. в фибриллогенезе этого белка. Предложена стратегия для ингибирования образования префибриллярных форм белков. Установлен потенциальный механизм участия зеркально-симметричных мотивов в фибриллогенезе. На основании такого механизма разработан и синтезирован пептид, идентичный участку последовательности лизоцима и способный оказывать влияние на фибриллогенез этого белка.

При первом же общении с Александрой Лотос получил лишнее подтверждение тому, что фамилия или выбранный человеком псевдоним, чаще всего, не случайны. Лотос – цвет совершенно удивительный, - он может произрастать где угодно (на озёрах, в прудах, на болотах и т.д.) и не смачиваться с той средой, из которой его цвет произрастает, которая служит ему питательной средой. И пусть будет окружающая его среда, какой угодно, но цвет лотоса всегда благоухает и щедро дарит свой нектар окружающему миру. Над ним любят летать шмели и пчёлы, наслаждаясь его удивительным ароматом, и, собирая нектар с его лепестков. Чем больше он дарит нектара, тем всё больше он благоухает. Когда я попросил Александру Лотос поделиться нектаром своих стихов на страницах МФК «Юной Россы», она ответила: «берите хоть всё, мне нисколько не жаль»; помещайте материал, как сочтёте нужным. Это не праздные слова, это её сущность – Божественная Радость Дарения. Не случайно в качестве эпиграфа к её странице в Интернет служат три слова: «Здесь нет лжи». Далеко не каждый из нынешних поэтов может позволить себе такой высоты этическую «планку», сохраняя совесть спокойной. Такой Дар Божий лишь немногих по силам. Александра откровенно дала мне понять, что ещё не волшебница в поэзии, и только ещё учится на волшебницу. Пожелаем же ей счастливой путеводной поэтической звезды… Я позволил себе внести скромную лепту в поэтический мир Александры Лотос (с её разрешения), сделал параллельный, вольный перевод её стихов на немецкий язык, которым говорили Гёте, Шиллер и Гейне. Александр СИГАЧЁВ

У некоторых людей такой шустрый метаболизм, что их буквально ничего на свете не способно сделать толстыми. Эти счастливчики могут в огромных количествах потреблять картофельные чипсы, заедая их приличными порциями сливочного пломбира, и при этом ни одного грамма лишнего жира не копится на их сухих и подтянутых телах.

В статье приводятся примеры собственного биоинформационного исследования пептидов и белков (силикатеинов, силиказы, силаффинов, транспортеров кремния, магнетосомных белков), участвующих в биоминерализации, с использованием современных компьютерных методов.

Данная статья является продолжением нашего исследования белков биоминерализации, обнаруженных в диатомеях, губках, магнитотаксических бактериях, а также поиска их гомологов среди белков растений, животных и других форм жизни. В частности, на уровне целых последовательностей и их отдельных участков in silico показана различная степень гомологии фрустулинов (Cylindrothecafusiformis, Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055 / 1, Naviculapelliculosa, Thalassiosirapseudonana), представляющих семейство кальций-связываюших гликопротеинов, участвующих в формировании видоспецифичного биокремнеземного панциря диатомей, с белками вирусов, бактерий, простейших многоклеточных, червей, насекомых, устриц, ланцетников, рыб, млекопитающих, в том числе человека, а также грибов и растений.

Семейство пептидных рецепторов, сопряженных с G-белками, а также их лигандов - эндогенных пептидов - вовлечено в регуляцию многих важных физиологических процессов в организме, вследствие чего они являются привлекательными мишенями для фармакологических исследований и конструирования лекарств (drug design). В связи с завершением черновой расшифровки генома человека стало возможным получение исчерпывающей картины всех генов, кодирующих как пептидные рецепторы, так и соответствующие им пептиды. С применением стандартных методов биоинформатики (поиск по гомологии, кластерный анализ, построение профилей и т.п.) предпринята попытка идентификации всех пептидных рецепторов, сопряженных с G-белками, и их лигандов в геноме человека. В результате проведенного исследования мы показали, что вероятное количество пептидных рецепторов в геноме человека составляет 218, а пептидов (пептидных предшественников) - 126 последовательностей. Идентифицировано 12 новых потенциальных пептидных рецепторов, сопряженных с G-белками, и 10 новых пептидных предшественников. По гомологии с известными последовательностями нами определена их вероятная функция. Проведена классификация всех вероятных пептидных рецепторов на основе их лигандной специфичности. Обсуждается лиганд-рецепторное соответствие пептидов и их рецепторов в геноме человека.

Прием обогащенного изолятом соевого белка печенья на протяжении 2 месяцев в количестве 30г соевого белка ежедневно здоровыми людьми сопровождался достоверным снижением общей протеолитической активности) на 22% и увеличением трипсин-ингибиторной активности сыворотки крови на 22%.

Методами биоинформатики (in silica) на уровне целых полипептидных цепей и отдельных участков аминокислотных последовательностей установлена (с учетом открытых новых протеинов) степень гомологии внутри групп белков биоминерализации силаффинов, силацидинов и силикатеинов. Для типичных представителей данных белков, а также силиказы (единственный представитель), был произведен поиск гомологов первичной структуры из числа известных пептидов и полипептидов (обработано около 2000 аминокислотных последовательностей). Сходство первичных структур гомологов силаффинов составило 21-94% (E-value от 0 до 5.0×10-6), силацидинов – 45-98% (E-value от 2.0×10-3 до 6.7×10-2), силикатеинов – 39-50% (E-value от 3.0×10-89 до 1.0×10-88), силиказы – 28-40% (E-value от 8.0×10-43 до 1.0×10-17). Проанализировано распределение гомологов по семействам вирусов, а также классам бактерий, растений и животных. Сопоставлены биологические функции исследуемых белков и их гомологов.

Данный обзор посвящен силаффинам, недавно открытым матричным пептидам и белкам, участ- вующим в формировании кремниевого панциря диатомовых водорослей. Приводится подробное описание номенклатуры, химической природы, механизма действия, а также практического при- менения силаффинов. Статья включает интересные иллюстрации из оригинальных работ.