Обосновывается необходимость обновления системы регионального управления, ее приведения в соответствие с инновационными условиями и задачами. Разработаны рекомендации, направленные на активизацию инновационной деятельности в регионе.
Проблемы теории и практики управления. 2014. № 1. С. 29-35.

В статье представлены актуальные требования к современной системе регионального управления. Раскрыто понятие «стратегическая инновационность». Определены организационно-экономические и кадровые особенности и проблемы системы регионального управления. Обоснованы практические рекомендации по развитию управления инновационными процессами в регионе.
Экономика и предпринимательство. 2013. № 5. С. 141-145.

Освещены актуальные вопросы перехода российских регионов к инновационной экономике. Сформулированы предложения и рекомендации по масштабной структурной перестройке народохозяйственного комплекса региона на основе стратегического подхода, создания непрерывно функционирующей региональной инновационной системы, комплекса мер господдержки и стимулирования инновационной активности, организационно-структурного преобразования в системе регионального управления.
Интеллект. Инновации. Инвестиции. 2012. № 1. C. 102-107.

Дается авторская трактовка термина «региональное управление», выделяются современные закономерности регионального управления, уточняются его принципы и обобщаются актуальные задачи. Обосновывается и формулируется понятие «организационно-экономический механизм» управления регионом; выстраивается его концептуальная модель.
Вестник Челябинского государственного университета. 2009. № 3. С. 47-56.

Освещены актуальные вопросы перехода российских регионов к инновационной экономике. Сформулированы предложения и рекомендации по масштабной структурной перестройке народохозяйственного комплекса региона на основе стратегического подхода, созданию непрерывно функционирующей региональной инновационной системы, комплексу мер господдержки и стимулирования инновационной активности, организационно-структурному преобразованию в системе регионального управления.
Интеллект. Инновации. Инвестиции. 2012. № 1. С. 102-107.

В статье представлены актуальные требования к современной системе регионального управления. Раскрыто понятие «стратегическая инновационность». Определены организационно-экономические и кадровые особенности и проблемы системы регионального управления. Обоснованы практические рекомендации по развитию управления инновационными процессами в регионе.
Экономика и предпринимательство. 2013. № 5. С. 141-145.

В статье аргументируется необходимость корректировки федерального законодательства в части предоставления регионам полномочий по созданию особых экономических зон и предлагается применение режима зоны предпринимательской устойчивости как инструмента регионального антикризисного управления.

Статья посвящена обзору механизмов реализации административной реформы в субъектах Российской Федерации
Коньков А. Е. Административная реформа на местах: стимулы и принуждения // Власть, 2006, № 12.

Автореферат диссертации на соискание учёной степени кандидата политических наук
Коньков А. Е. Центр-периферийные отношения в Российской Федерации в условиях административной реформы : Автореф. дисс. … канд. полит. наук : 23.00.02 / МГУ им. М. В. Ломоносова. – М., 2008. – 24 с.