Монография посвящена микробиологическим методам получения органических соединений из ряда азотистых гетероциклов (азааренов, хинолонов и насыщенных азотистых гетероциклов). Предлагается поиск альтернативных путей синтеза веществ, которые трудно получить с помощью обычных методов органическй химии. Микробные технологии могут найти практическое применение в разработке различных лекарственных средств.
Паршиков И.А. Микроорганизмы в химии азотистых гетероциклов. – М.: Паршиков Игорь Альбертович, 2017. −130 с. ISBN 978-5-600-01772-6

Микробиологическая характеристика возбудителя туберкулеза у больных туберкулезом из разных социально-демографических групп/Иванова Н.А., Монгуш А.В.//Научный руководитель: д.м.н., профессор Казимирова Н.Е./ГБОУ ВПО Саратовский ГМУ им. В.И. Разумовского Минздрава РФКафедра фтизиопульмонологииМикробиологическая характеристика МБТ, циркулирующих в популяции больных, отражает качество организации выявления, лечения и диспансерного наблюдения за больными туберкулезом, а также способствует созданию прогностической модели развития инфекционного процесса.Цель исследования: определить особенности МБТ у впервые выявленных больных туберкулезом.Материалы и методы. Данные по лекарственной устойчивости МБТ у 130 больных впервые выявленным туберкулезом органов дыхания.Результаты. Среди обследованных больных-жителей г. Саратова преобладали лица трудоспособного возраста. Мужчины составляли 61%. Клинические формы туберкулеза: очаговый туберкулез – 7%, инфильтративный – 75%, туберкулемы – 5%, кавернозный – 1%, диссеминированный туберкулез – 12%. 25% обследованных больных поступили в диагностическое отделения противотуберкулезного стационара после неэффективного лечения в пульмонологических отделениях ОЛС. При сравнении микробиологических характеристик МБТ получено, что при предшествующем приеме а/б широкого спектра действия уровень лекарственной устойчивости МБТ в 2 раза превышал показатели ЛУ группы, не принимавших препараты. Также выявлено, что в группе больных, проживающих в центральных районах города, ЛУ МБТ достигала 85,7%, что в 1,4 раза превышало уровень ЛУ возбудителя у больных, проживающих в менее престижных районах, но при этом в спектре ЛУ МБТ, выделенных у больных из центральных районов, чаще встречаются более тяжелые формы ЛУ.Среди пациентов с ЛУ туберкулезом в 1,5 раза чаще встречались мужчины, лица трудоспособного возраста составляли 91%, но превалировали лица без постоянного места работы (58,7%) и не имеющих полноценной семьи.Выводы. К группе высокого риска по ЛУ ТВС среди жителей промышленного центра относятся мужчины трудоспособного возраста, не имеющие постоянной работы и семьи, проживающие в центральных районах, принимавшие а/б широкого спектра действия до госпитализации в противотуберкулезный стационар.
Иванова Н.А., Монгуш А.В. Микробиологическая характеристика возбудителя туберкулеза у больных туберкулезом из разных социально-демографических групп // Бюллетень медицинских Интернет-конференций, Vol. 5, Issue 5, 2016, pp. 847-847

The fungal and bacterial transformation of terpenoids derived from plant essential oils, especially the sesquiterpenoid artemisinin from Artemisia annua, has produced several new candidate drugs for the treatment of malaria. Obtaining new derivatives of terpenoids, including artemisinin derivatives with increased antimalarial activity, is an important goal of research in microbial biotechnology and medicinal chemistry.
Biotech. Adv. 30.03.12. URL: http://dx.doi.org/10.1016/j.biotechadv.2012.03.010 (дата обращения 22.04.2012)

Pyridine, quinoline, acridine, indole, carbazole, and other heterocyclic nitrogen-containing compounds (azaarenes) can be transformed by cultures of bacteria and fungi to produce a variety of new derivatives, many of which have biological activity. In many cases, the microbial biotransformation processes are regio- and stereoselective so that the transformation products may be useful for the synthesis of new candidate drugs.
Applied Microbiology and Biotechnology. 2012. V.95. N 4. P.871-889, DOI: 10.1007/s00253-012-4220-z

Изучена трансформация аналога лекарственного препарата «Такрин» грибами.
Chemistry of Heterocyclic Compounds. 1994. V.30. N5. P.627-628; Chemical Abstracts 1995, v. 122, 290697j.

Микробиологическая трансформация производных мирценаля
Химия гетероциклических соединений. 1994. N5. C.711; C.A. 1995. v.122, 290613d.

Представлены основные принципы взаимоотношений микроогранизмов и растений.

В статье приведены краткие сведения об использованных в ходе проведения работы информационных технологиях
Ерина Н.В. Использование информационных технологий при изучении эпифитной микрофлоры // Биоразнообразие, биоресурсы, новые материалы и здоровье населения региона: Материалы 55 научно-методической конференции «Университетская наука - региону»(6-30 апреля 2010 года). – Ставрополь:СГУ, 2010. – 226 с.(с. 203-205)

Водные экосистемы и организмы-7. Труды научн. конференции: Москва, 15 октября 2005, М.: МАКС Пресс, 2006. - 208 с. (http://scipeople.com/publication/70167/). Ecological Studies, Hazards, Solutions. Volume 11. Proceedings of the scientific conference ‘Aquatic Ecosystems and Organisms – 7’ (October 15, 2005, Moscow), and other materials. Moscow, MAX Press, 2006. – 208 p. ISBN 5-317-01716-5. Cборник содержит научн. труды 7-q конференции “Водные экосистемы и организмы-7”, которая прошла 15.10.2005 в Московском университете , и другие материалы. Тематика материалов охватывает пресноводные и морские экосистемы и организмы. Акцентируются научные инновации, важные для решения практических проблем, для экономического роста, для экологической безопасности; напечатаны новые авторские программы учебных курсов: Концептуализация …приоритетных и нерешенных проблем экологии (стр. 159), Экология (с. 165), Механизмы взаимодействия организмов в экосистемах (с.168), Введение в общую биохимическую экологию (с. 170), Введение в биохимическую экологию водно-пищевого рациона человека (с. 172), Количественная и теоретическая гидробиология (с. 175), Самоочищение воды и ее качество (с. 178), Экологическая политика и устойчивое развитие (с. 181), Environmental Problems and Sustainability: New Course Curriculum (с.182), Ecological Engineering: General and Selected Issues. Additional Focus on Water (с. 185). Авторы представленных работ - сотрудники различных кафедр и факультетов МГУ, ученые др. институтов России, США, Украины, Швейцарии и др. стран. Сборник представляет интерес для специалистов в области экологии, гидробиологии, океанологии, зоологии, ихтиологии, ботаники, микробиологии, охраны окружающей среды, для преподавателей высшей школы. Приведены имена ученых, которым присвоено почетное звание «Водный эколог года» - акад. М.Г.Хубларян и др. Volume 11 of the series includes the proceedings of the 7th conference ‘Aquatic Ecosystems and Organisms - 7’ includes the presentations at the conference that took place at Moscow State University, October 15, 2005, and some other materials. The materials cover freshwater and marine ecosystems and organisms. In addition to scientific materials, the programs (curriculae) of the modernized lecture courses were given: Key unsolved issues of ecology; Ecology; Mechanisms of organismal interactions in ecosystems; General biochemical ecology; Biochemical ecology of drinking water and human nutrition; Quantitative and theoretical hydrobiology; Water self-purification and water quality; Environmental policy and sustainable development; Environmental Problems and Sustainability; Ecological Engineering: General and Selected Issues. Additional Focus on Water. The authors represent various departments of Moscow State University and other institutions and universities of Russia, Switzerland, Ukraine, the U.S.A., and other countries. The proceedings are of interest to scholars in the fields of ecology, limnology, oceanography, zoology, ichthyology, botany, microbiology, environmental science, as well as to university professors and educators. The names of laureates who were awarded the honorary title ‘Aquatic Ecologist of Year’ are published. Among them – Academician M.G. Kublaryan and others. ISBN 5-317-01716-5. Key words: conference, ‘Aquatic Ecosystems and Organisms - 7’, Moscow State University, freshwater, marine, ecosystems, organisms, institutions and universities of Russia, Switzerland, Ukraine, the U.S.A., ecology, limnology, oceanography, zoology, ichthyology, botany, microbiology, environmental science, laureates, honorary title ‘Aquatic Ecologist of Year’, biosphere, environment, biology, water, hydrosphere, environmental safety, sustainability, conservation, biodiversity

Котелевцев С.В., Орлов С.Н., Остроумов С.А. Изучение симбиотических ассоциаций (ассоциативного симбиоза) в микробиальных биоценозах водоемов. Анализируются вопросы, изложенные в книге О. В. Бухарина и Н. В. Немцевой «Микробиология биоценозов природных водоемов») // "Екологія довкілля та безпека життєдіяльності" (2008), № 5. c. 84-86. http://eko.org.ua/ru/magazine/5-2008/ [= Kotelevtsev S., Orlov S., Ostroumov S. Studying symbiotic associations (associative symbiosis) in microbial biocoenoses of aquatic bodies. (Analysis of the issues described in the book: O.V.Bukharin, N.V.Nemtseva «Microbiology of biocoenoses of natural aquatic bodies») . - «Ecology of surroundings and safety of vital activity» 2008.No.5, p. 84-86]. В 2008 г. опубликована книга О. В. Бухарина и Н. В. Немцовой “Микробиология биоценозов при- родных водоемов” (Екатеринбург, издательство Уральского отделения РАН, 156 с.). Книга дает воз- можность более глубоко понять экологию водоемов и содержит большой объем новой информации, важной для формирования научных основ оценки экологического состояния водоемов, биоиндика- ции, для санитарной гидробиологии и прикладной микробиологии источников водоснабжения. В книге представлены материалы по взаимо- отношениям симбионтов в биоценозах природных водных экосистем. Книга состоит из Введения, четырех глав и заключения. Краткое Введение содержит очень важные сведения. Упомянут принцип, обозначенный Гамильтоном в 1843 г. как ассоциативность – обра- зование ассоциаций микроорганизмов с различ- ными типами связей. Даны определения важных терминов – эндоцитобиоза (расположение микро- организмов в клетках своих хозяев – таких, как водоросли и простейшие) и ассоциативного сим- биоза. Последний термин введен О.В. Бухариным. В первой главе (с. 12–45) рассмотрены основ- ные типы микробиоценозов водоемов. В отдельных разделах анализируются следующие ассоциации. 1. Ассоциации простейших с бактерия- ми. Рассмотрено множество разнообраз- ных примеров симбиозов простейших (родов Chlamydaster, Amoeba, Vanella, Tetrahymena и других) с бактериями родов Vibrio, Aeromonas, Mycobacterium,Campilobacter, Salmonella, Shigella, Listeria, Pseudomonas, Klebsiella, Staphylococcus, Serratia и других. 2. Ассоциации простейших с водорослями. Обсуждаются многие примеры симбиотических ассоциаций простейших родов Amoeba, Majorella, Pleuronema с ассоциированными с ними водорос- с ассоциированными с ними водорос- лями родов Coelastrum, Chrysococcus, Kephyrion и др. Во многих случаях эндосимбиотические водо- росли (зоохлореллы, зооксантеллы, цианеллы и др.) обеспечивают значительную часть энергетических потребностей простейших, создают возможность миксотрофии для гетеротрофных простейших. 3. Ассоциации водорослей с водорослями. В этом разделе авторы расширительно трактуют тер- мин водоросли и включают в него сине-зеленые водоросли, которые, по более строгой термино- логии, относятся к бактериям (цианобактерии). В данном разделе приведены интересные примеры того, как в слизи цианобактерий поселяются другие цианобактерии, диатомовые и зеленые водорос- ли. Есть и другие примеры, где точно определить характер ассоциации (симбиоз или паразитизм) затруднительно. 4. Ассоциации водоросли – бактерии. Как отмечают авторы, “ценозообразующая роль водо- рослей обусловлена, во-первых, способностью образовывать слизистые чехлы и колониальную слизь, во-вторых, наличием внеклеточных органи- ческих выделений” (с. 29). Это способствует обра- зованию ассоциаций водорослей родов Pandorina, Chlamydomonas, Chlorella, Spirulina, Dunaliella c бакте- риями Pseudomonas, Flavobacterium, Agrobacterium, Achromobacter, Bacillus, Chromobacterium, Sarcina, Vibrio, Micrococcus, Rhodococcus и другими. 5. Бактерии – бактерии. Приведены интересные примеры ассоциаций бактерий. Так, установлены ассоциации бактерий, разлагающих целлюлозу, и азотфиксаторов. Acinetobacter часто ассоциирован с микрококком и дрожжами Candida. Синтрофной ассоциацией является Methanobacterium omelian- skii – ранее это считалось чистой монокультурой метаногенов. Выявлен микробный биоценоз гипер- соленых озер, в который входят галофильные и галотолерантные бактерии, причем галофильные бактерии делятся со своими партнерами осмопро- текторами. Во второй главе “Модельные функциональ- ные системы биоценозов” (с. 46) рассмотрены три защитных системы во взаимодействиях про- и эукариотических микроорганизмов, причем для всех трех защитных систем обнаружены механизмы их преодоления, которые присущи некоторым из водных микроорганизмов. Авторы подробно изучили систему “лизоцим- антилизоцим”. Показано, что лизоцимной активно- стью обладает очень высокая для изолятов многих групп организмов – Ciliophora, Sarcomastigophora, Streptococcaceae, Micrococcaceae, Bacillaceae, и дру- гие. Этой активностью обладают более 40 % изолятов Chlorophyta и более 20 % изолятов Cyanophyta (с. 48). Вместе с тем у многих организмов выявлена антили- Page 2 Екологія довкілля та безпека життєдіяльності, №5 2008 85 зоцимная активность – прежде всего у патогенных, условно-патогенных и сапрофитных микроорганиз- мов, например у энтеробактерий, аэромонад, ста- филококков. Антилизоцимная активность найдена у почти 90 % изолятов Enterobacteriaceae, более 70 % изолятов Pseudomonaceae, около 50 % изоля- Pseudomonaceae, около 50 % изоля- тов Cyanophyta, более 40 % Chlamidobacteriaceae, у многих других групп организмов (с. 50). В работах О.В. Бухарина разработано представление о том, что биологическая целесообразность антилизо- цимного фактора в условиях инфекционной пато- логии состоит в защите пептидогликанового поли- мера прокариот от воздействия лизоцима. Авторы детально изучили формы микроорганизмов, имею- щие лизоцимную активность (ЛА) и обладающие антилизоцимной активностью (АЛА). Ими получен большой экспериментальный материал о присут- ствии и численности ЛА- и АЛА-форм в ассоциаци- ях “бактерия – бактерия”, “водоросль – водоросль”, “водоросль – бактерия”, “простейшие – водоросль”, “простейшие – бактерии”. Авторы обнаружили, что лизоцим- антилизоцимные взаимодействия важны для выжи- вания бактерий не только в воде природных экоси- стем, но и в питьевой воде. Формирование симбио- тических связей бактерий с простейшими и водо- рослями имеет большое значение для качества питьевой воды, поскольку бактерии могут успешно преодолевать барьер фильтрационных сооруже- ний, находясь в слизистых чехлах водорослей или в фагосомах простейших (с. 74). Авторы сформулиро- вали тезис о трояком значении системы “лизоцим- антилизоцим”: обеспечение жизнедеятельности биоценоза, механизм выживания, регуляция гете- рогенности микробных популяций (с. 76). Вторая система, важная для формирования ассоциативных связей – функциональная связка “гистоны эукариот – антигистоновая активность прокариот” (с. 77–90). В 1992 г. О.В. Бухарин описал способность бактерий инактивировать бактери- цидный эффект гистонов эукариотических клеток. В книге на стр. 84–90 описаны опыты, доказывающие роль антигистоновой активности бактерий в фор- мировании ассоциативных связей с простейшими. Третья система – “перекись водорода водорос- лей – каталазная активность бактерий” (с. 90–97). Cерия оригинальных опытов по сокультивирова- ерия оригинальных опытов по сокультивирова- нию водорослей с каталазными и безкаталазными штаммами кишечной палочки показала, что высо- кая жизнеспособность (выживаемость) была харак- терна для штаммов с высоким уровнем каталазной активности. На этой основе авторы полагают, что “штаммы бактерий-ассоциантов водорослей с высо- ким и средним уровнем исследуемого признака могут выступать в роли симбионтов (резидентных штаммов), тогда как остальные – рассматривать- ся как случайная (транзисторная) бактериофлора” (с. 94). Следующая, третья глава посвящена регуляции межмикробных отношений симбионтов. Первый из двух разделов этой главы излагает новые интерес- ные данные о влиянии аутоиндукторов анабио- за на симбиотические отношения гидробионтов (с. 98–105). Среди экзометаболитов водорослей идентифицировано более 300 веществ. Из них 10–40 % участвуют в регуляции микробных попу- ляций, обитающих вокруг водорослевых клеток в их фикосфере. Выявлены конкретные вещества, участвующие в ауторегуляции роста и развития популяций микроорганизмов. К ним относятся аутоиндукторы анабиоза (алкилоксибензолы, АОБ, факторы d1, фd1) и аутоиндукторы аутолиза (свобод- ные ненасыщенные жирные кислоты, СНЖК, факто- ры d2, фd2). Обе группы ауторегуляторов обладают мембранотропным действием. По некоторым дан- ным, факторы первой группы увеличивают микро- вязкость биомембран, а факторы второй группы, наоборот, повышают степень текучести липидной составляющей биомембран. По некоторым пред- ставлениям, кооперативное действие фd1 и фd2 (соотношение фd1 и фd2) представляет собой ауто- регуляторный механизм и эндогенную причину смены стадий развития и метаболических превра- щений в популяциях микроорганизмов (обзор см. на с. 99). Авторы подробно изучили роль АОБ (на примере химического аналога ауторегуляторного фактора d1 бактерий, С12-АОБ) в регуляции меж- микробных взаимодействий в альгобактериальных ассоциациях хлорококковой водоросли Coelastrum microporum и сопутствующих ей бактериальных симбионтов. Из проведенных опытов вытекает предположение, что бактерии-спутники оказывают защитный (протективный) эффект и способствуют устойчивости ассоциативной культуры водоросли к действию АОБ (с.100). В другом разделе этой главы авторы описы- вают новые интересные данные о ингибировании роста условно-патогенных бактерий под действием клеточных экстрактов ряда культур водорослей (в том числе Scenedesmus obliquus, Chlorella sp., Chlamydomonas reinhardii, представителей родов Pediastrum, Chlorococcum и др.). Было обнаруже- , Chlorococcum и др.). Было обнаруже- Chlorococcum и др.). Было обнаруже- и др.). Было обнаруже- но ингибирование роста тест-штаммов Escherichia coli, Klebsiella ozaenae, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus (с. 108–109). Поэтому прак- aureus (с. 108–109). Поэтому прак- (с. 108–109). Поэтому прак- тическую пользу может принести использование исследованных культур микроводорослей для доо- чистки сточных и загрязненных вод. В последней, четвертой главе (с. 111 и далее) проанализирован исключительно важный для практики вопрос об использовании микробных биоценозов для биоиндикации и мониторинга экологического состояния водоемов. Рассмотрены исключительно важные для практики методы микробиологической индикации состояния водо- емов. Среди этих методов – определение общего Page 3 Екологія довкілля та безпека життєдіяльності, №5 2008 86 микробного числа (ОМЧ), анализ и оценка сапроб- ности, метод сапробной валентности, биологи- ческая оценка качества воды с использованием санитарно-показательных микроорганизмов (СПМ). Отдельный раздел посвящен микробным биоцено- зам как инструментам экологического мониторинга водной среды (с. 124–126). Предложено для выяв- ления экологического неблагополучия в водое- ме использовать анализ биоценотических связей гидробионтов на примере симбиотических взаимо- действий. Авторы установили, что для улавливания изменений в водоемах информативным параметром является лизоцимная и антилизоцимная активность гидробионтов (микроводорослей). Персистентные показатели микрофлоры – антилизоцимная, анти- комплементарная и антиинтерфероновая актив- ности ЛКП (лактозопозитивных кишечных палочек) могут служить маркерами санитарного неблагопо- лучия водоема, для выявления свежего фекального загрязнения, а также при оценке качества питьевых вод и выборе способа обеззараживания при водо- подготовке. Этот подход может пригодиться при тестировании поллютантов, при расчете индексов сапробности для водорослей, оценке трофности водоема, что полезно для санитарной практики. В другом разделе сформулированы и обоснованы новые направления использования симбиотиче- ских взаимодействий водных микроорганизмов в лабораторной практике. Таковыми направлениями являются: разработка методов тестирования био- логических свойств микроорганизмов, выделение чистых (аксенических) культур микроорганизмов, подбор методов культивирования микроорганиз- мов, отбор штаммов продуцентов биологически активных веществ. В Заключении (с. 132–135) сделаны интересные выводы и обобщения. Отмечено, что “в микробном сообществе гидробионтов имеет место феномен ассоциативного симбиоза. При этом центровое зна- чение отводится организму-хозяину, вступающему в различного рода взаимодействия как с постоян- ными, так и с временными партнерами”. Отмечено также, что ассоциативный симбиоз природных водных микроорганизмов – это самоуправляющая- ся и саморегулирующаяся система, включающая особь вида-хозяина и особи видов-симбионтов (с. 132). К категории макропартнера или организма- хозяина в микробиоценозе можно отнести водо- росли или простейших, способных к эндоцитобио- зу. Большое практическое значение имеет тот факт, что в природных водных биоценозах указанные симбиозы представлены как автохтонной, так и аллохтонной микрофлорой, в состав которой вхо- дят условно-патогенные и патогенные для чело- века и животных микроорганизмы. Результатом такого симбиоза является выживание патогена во внешней среде и сохранение его вирулентности. Приведенные в книге материалы продолжают серию публикаций О.В. Бухарина и соавторов [1, 2] и закладывают базу для формирования нового научного направления – экспериментальной сим- биологии, которая обогащает спектр современных биологических дисциплин. Выявление новых сведений о связях и ассоциа- циях гидробионтов имеет большое экологическое значение, углубляет продуктивный синэкологиче- ский подход в биологии и экологии [2]. Книга содержит ценную обширную библио- графию, прекрасно иллюстрирована оригинальны- ми цветными фотографиями микроводорослей и других микроорганизмов. Безусловно, книга пред- ставляет ценный вклад в науку и принесет пользу гидробиологам, микробиологам, специалистам по экологии и санитарному состоянию водоемов и водотоков. ЛИТЕРАТУРА 1.Бухарин О. В. Персистенция патогенных бактерий. –М.: Медицина, 1999. – 367 с. 2.Бухарин О.В., Лобакова Е.С., Немцева Н.В., Черкасов С.В. Ассоциативный симбиоз. – Екатеринбург: УрО РАН,2007. – 264 с.