Ефремов Р.Г. Исследование структуры и механизма функционирования ретиналь- содержащих мембранных белков: кристаллизация и фиксация промежуточных состояний белков в кристаллах: автореф. дис. ... канд. физ.-мат. наук : 03.00.02. - M, 2010.

Романова Т.А., Краснов П.О., Аврамов П.В. Выбор кластерных моделей для исследования электронной структуры и динамики атомного остова гемсодержащих белков методами QM/MM и ONIUM // Электронный журнал "Исследовано в России", 1-4, 1009-1016, 2001. http://zhurnal.ape.relarn.ru/articles/2001/091.pdf

В статье рассматриваются теоретические аспекты безопасного уровня потребления белка и энергии на основе изучения материалов публикаций технических докладов ФАО / ВОЗ и анализируется качество говядины, произведенной по интенсивной технологии, на предмет соответствия требованиям современного потребителя по энергетической ценности и питательности. Дается обоснование интенсификации отрасли при производстве высококачественной говядины для полного обеспечения населения продуктами животного происхождения.

В экспериментах in vitro установлено, что культуры Staphylococcus aureus менее чувствительны к бактерицидному действию катионного белка лейкоцитов человека "интерцида" (мол. масса 11,0-11,5 кД), чем коагулазоотрицательные стафилококки. Показаны адаптация стафилококков и повышение их устойчивости к "интерциду" при культивировании бактерий в МПБ с данным катионным белком (2 мг/мл) в течение трех пересевов. Ключевые слова: S. aureus, коагулазоотрицательные стафилококки, катионный белок лейкоцитов, бактерицидность, адаптация

Описано новое биологическое свойство анаэробных микроорганизмов фекальной флоры при дисбиозе кишечника, направленное на инактивацию одного из факторов неспецифической резистентности – антимикробного белка тромбоцитов (b-лизина). Выявлены межвидовые различия в распространенности и выраженности данного признака среди копроштаммов анаэробных бактерий различных групп. Указанное свойство рассматривается в качестве одного из механизмов адаптации неспорообразующих анаэробных микроорганизмов к защитным системам организма хозяина.

Предложен новый алгоритм для поиска белков по заданному филогенетическиому профилю, соответствующая программа была разработана одним из авторов (Л. Леонтьевым). А также приведены результаты счета для различных наперед заданных филогенетических профилей.

Калориметрическим методом исследован фазовый переход первого рода, наблюдающийся для половины (sim 50{%}) связанной воды в коллагене сухожилия хвоста крысы. Показано, что величина скрытой теплоты перехода, температура перехода и теплоемкость высокотемпературной фазы данной подсистемы близки к характеристикам свободной воды. Свойства другой половины связанной воды (sim 50{%}) в коллагене близки к свойствам цеолитной воды.

Экспериментально обнаружена и описана новая аллотропная неравновесная форма белка (в дальнейшем для краткости "протос"), представляющая собой самосборку, кластерной пленки протеина in vitro, идентифицированной с "фолдингом"1 белка in vivo [1-7]. Визуализация (на микро- и макроуровне) динамики процесса конденсации белка в неравновесных условиях в открытой системе белок--вода in vitro (при относительно быстром испарении воды) позволила установить нелинейную хаотическую динамику процесса. В полученной пленке белка отсутствовал дальний порядок и возникал новый морфологический высокоструйный порядок на нано- и макроуровне. При этом удалось получить целый спектр не идентифицированных ранее свойств белка (структурных, электрических, магнитных), которые существенно отличаются от свойств равновесных кристаллических образцов.

В настоящее время известна и хорошо изучена только одна твердотельная кристаллическая форма белка. В то же время нами экспериментально обнаружено, что твердотельная фаза белка может иметь принципиально различные свойства, виды и масштабы симметрии в зависимости от условий конденсации системы белок--вода. Критическим условием является кинетика данного процесса. Так, в закрытой системе в равновесных условиях (низкая скорость процесса) на микроуровне возникает равновесная кристаллическая решетка белка дальнего порядка. В открытой неравновесной системе белок--вода (относительно высокая скорость) возникает автоволновой процесс с нелинейной хаотической динамикой и образуется полипленочная твердотельная фаза с каскадом трехмерных диссипативных наноструктур. Изменяются виды и масштабы симметрии. Исчезает кристаллический порядок на микроуровне, материал становится аморфным. Появляется новая аллотропная модификация твердой неравновесной пленки белка с высокоупорядоченной сверхрешеткой от нано- до макроуровня (с прямолинейной, спиральной, хиральной, зеркальной, поворотной симметрией). Феноменология этого вида белка идентифицитрована in vitro и in vivo и названа "протос".

Представлены выраженные изменения физической фазы и динамики фазового перехода белков высыхающей плазмы крови. Сравнительная морфологическая (топологическая) картина таких неравновесных пленок у доноров и пациентов с метастатической карциномой различной природы качественно отличалась нарушением динамики процесса самосборки пленок белка с изменением видов симметрии. Нарушалось дефектообразование, появлялись твердые кристаллы. Длительное время сохранялась фаза жидких кристаллов и др. Метод микроскопического изучения топологии высыхающей плазмы белка может быть диагностическим тестом для выявления метастазирования карциномы.