Поиск и оптимизация новых ингибиторов интегразы ВИЧ-1 является актуальной задачей вследствие имеющих место недостатков существующих лекарств для терапии ВИЧ/СПИД, обусловленных наличием побочных эффектов, высокой стоимостью лечения и возникновением резистентности. В работе продемонстрирована перспективность применения компьютерных методов для поиска и оптимизации ингибиторов реакции 3’-процессинга, осуществляемой интегразой ВИЧ-1. Показана возможность применения специализированной версии компьютерной программы PASS для поиска среди коммерчески доступных образцов химических соединений оригинальных ингибиторов реакции 3’-процессинга, принадлежащих к новому химическому классу. Сравнение общих фармакологических профилей, рассчитанных с помощью PASS для выборки оригинальных ингибиторов интегразы и выборки ингибиторов, известных из литературы, показало, что прогнозируемая селективность оригинальных соединений в среднем сопоставима с селективностью известных ингибиторов, а вероятность проявления побочных/токсических эффектов ниже у оригинальных веществ. Отличия фармакологических профилей оригинальных соединений от известных из литературы ингибиторов 3’-процессинга указывают на существенную новизну веществ изучаемого нами химического класса. Анализ расчетных параметров QikProp, характеризующих ADME свойства молекул, показал, что для оригинальных соединений имеют место значительно меньшие отклонения от диапазона рекомендуемых значений по сравнению с параметрами для ингибиторов интегразы, известных из литературы. Сделан вывод о более высокой перспективности изучаемых нами оригинальных веществ по сравнению с известными из литературы ингибиторами 3’-процессинга.
Биомедицинская химия, 2009, 55 (5), 544-557.