Cравнительный трасологический анализ позволяет отличить естественные (патологические и инвазионные) изменения на твердых тканях живых организмов от искусственных (пиление, резание, сверление и истирание). Примером пиления в природе служит клиновидный дефект резцов крупного рогатого скота, возникающий вследствие воздействия на дентин и эмаль частиц поедаемых животными растительных стеблей. Без микроанализа результаты воздействия паразитов на иглы морских ежей также могут быть приняты за следы искусственной обработки. Следы сверления, произведенные раковинами Natica, практически ничем не отличимы от таковых, сделанных искусственно. Многолетние исследования макро- и микродеформаций позволили создать базу эталонов для различения артефактов и природных объектов со следами, имитирующими искусственную обработку.