В статье рассмотрены принципы формирования систем управления в холдинговых структурах, выявлены их особенности, обусловленные типом объединения и функциональными координациями. Предложен подход к построению системы управления агрохолдингами на основе сочетания стратегического управления, организационной, интегративно-управленческой и финансовой структур холдинга.