Явление синтении используется в филогенетике. Ноформирование синтенных групп генов можно объяснить двояко, как результат дивергенции видов и как следствие структурно-функциональной организации генома (СФОГ). Исследовали вклад СФОГ. Для этого анализировали синтенные группы (человек-мышь) на наличие функционального сходства у геново входящих в синтенную группу. Показано, что большая часть синтенных групп может быть объяснена исходя из СФОГ.
Информационно-вычислительные технологии в решении фундаментальных и прикладных научных задач. Сборник материалов. М.: 2005

Дадашев С.Я., Абраменко Е.Д., Женавчук О.Ф., Каганова Н.Л., Нурутдинова О.С., Стефанов Ю.Э., Шаронова Е.И. Функциональная характеристика генов, входящих в синтенные группы. Информационно-вычислительные технологии в решении фундаментальных и прикладных научных задач. Сборник материалов. М.: 2005