В данной работе был проведен сравнительный анализ данных о составе Fnr- и ArcA-модулонов, полученных экспериментально с помощью метода биочипов, и данных о составе Fnr- и ArcA-регулонов, полученных с помощью сравнительно-геномного подхода. Показано, что регуляторный каскад с участием белков Fnr и ArcA вносит существенный вклад в расширение Fnr-модулона по отношению к Fnr-регулону за счет оперонов ArcA-модулона. Кроме того, обнаружено 26 оперонов с консервативными сайтами связывания Fnr и 16 оперонов с консервативными сайтами связывания ArcA. На основании данных о составе Fnr- и ArcA-регулонов была выделена группа генов, так называемое “ядро” регулонов, с высококонсервативными сайтами связывания Fnr и ArcA и высокими значениями весов для этих сайтов.